يتكون مجلس الأمناء من عدد لا يقل أعضائه عن أحد عشر عضواً ولا يزيد على عشرون عضوا يكون من بينهم أعضاء الهيئة التأسيسية كأعضاء دائمين بالإضافة إلى عضو من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي وممثل لوزارة الخارجية ويتم اختيار بقية الأعضاء من كبار العلماء والمتخصصين والخبراء والشخصيات العامة دولياً ويكون رئيس الجامعة عضوا في هذا المجلس.
فترة المجلس
فترة تعيين أعضاء مجلس الأمناء من كبار العلماء والمتخصصين والخبراء والشخصيات العامة دولياً لمدة ثلاث سنوات قابلة للتجديد لفترة ثانية فقط بخلاف أعضاء الهيئة التأسيسية وعضو من وزارة التعليم العالي والبحث العلمي وممثل لوزارة الخارجية فعضويتهم دائمة.
ي.
رئاسة المجلس
يتولى رئاسة المجلس أحد أعضائه بالانتخاب الحر المباشر.
يتم اختيار رئيس مجلس الأمناء من الشخصيات الدولية البارزة ولها إسهامات ورؤى واهتمام بالتعليم والثقافة.
يشترط أن لا يكون رئيس مجلس الأمناء رمزا لمذهب ديني أو طائفي أو عنصري.
يختار مجلس الأمناء من بين أعضائه نائبا لرئيس المجلس يحل محله في حال غيابه.
آليات عمل المجلس
يعقد مجلس الأمناء جلساته العادية مرة واحدة في العام كما أن له أن يجتمع كلما دعت الحاجة لذلك وفي جميع الأحوال توجه الدعوة من رئيس المجلس أو بطلب من خمسة أعضاء يقدم لرئيس الجامعة لتوجيه دعوة للانعقاد مع بيان الأسباب والمبررات.
يرسل جدول الأعمال مع الأوراق المتعلقة به إلى أعضاء المجلس قبل موعد انعقاد الاجتماع بخمسة عشر يوماً.
لمجلس الأمناء مناقشة التقارير والموازنة التقديرية والحساب الختامي والاقتراحات، وطرح الرؤى والخطط الاستراتيجية المقدمة من رئيس الجامعة أو مما يتقدم به أحد أعضاء المجلس من توصيات، واعتماد برامج عمل الجامعة أو تعديلها، والطلب بإضافة أو حذف أو تعديل بعض لوائح النظام الداخلي للجامعة، ويكون ذلك بموافقة ثلثي المشاركين من أعضاء المجلس.
إذا لم يتوافر النصاب القانوني في الاجتماع الأول العادي لمجلس الأمناء يؤجل لمدة ساعة واحدة ويكون الاجتماع بعدها قانونياً مهما كان عدد الأعضاء الحاضرين وقراراتهم نافذة التطبيق ما لم تتعارض مع أهداف ورسالة الجامعة وخططها الإستراتيجية المصدق عليها مسبقاً.
يكلف نائب رئيس الجامعة للشئون المالية والإدارية أو من يختاره رئيس الجامعة من أحد نوابه لتولي سكرتارية اجتماعات المجلس وتدوين محاضر الاجتماع وصياغتها واعتمادها من رئيس مجلس الأمناء ورئيس الجامعة وتوجيهها للجهات المعنية بالجامعة